当地时间9月30日，波音737飞机从迪拜飞往特拉维夫，这是机长马赫查尔与副驾驶的第一次搭档。前两小时飞行中，两人只闲聊几句。副驾驶突然站起身，用驾驶舱内的应急斧朝机长头部连砍。第一记重击落在后脑时，马赫查尔误以为飞机出了严重故障，有部件掉下来砸中了自己，整个人前扑，差点压到操纵杆。随后他回头看才看清，右座副驾驶正握着应急斧砍向他的头。
副驾驶砍伤机长后抢过操纵杆，不到一分钟，飞机下降了17000英尺（约5182米）。危急时刻，马赫查尔先解开安全带，抬手去挡落下的斧刃。血一直在流，视野越来越窄。他一边喊同事的名字，一边把手伸向开门的旋钮，说：”那时候有个念头翻上来。我对自己说，好，我得让人进来。”
马赫查尔多次昏迷。每次醒来都是在门外的人砸门声中。挣扎中，他成功打开一次门，同事在门外喊，副驾驶在舱内喊，门立即被副驾驶关上。每用一次力，血就多流一阵，他就再昏迷一次。趴在地上时，他听到发动机从满推力降下来的声音：”那不是这个航段该听到的声音。”他对自己说，”做点什么，你不能就这么死。”再次伸手摸到旋钮，转开。
“最后一场搏斗，我全力以赴。”门打开了，人涌进来。有人用耳机线把副驾驶按住、捆起来，又用塑料扎带加固。马赫查尔被一名乘客拖出驾驶舱，脸朝下趴在驾驶舱和厨房之间。机上牙医肖塔·穆萨耶夫守在他头侧。他头部和左手出血很重，伤口很深，牙医整整45分钟没松手，一直用冰袋压着伤口。
两名当天以乘客身份搭机的迪拜航空飞行员接手了飞机，他们原本要执飞这架飞机的返程航班。飞机最后备降沙特阿拉伯塔布克。
马赫查尔因凹陷性颅骨骨折在沙特接受了颅骨修复手术，之后被转到阿布扎比继续治疗。出席10月27日授勋现场时，机长左臂还吊着医用吊带，后脑剃掉一大片头发，金属缝合钉沿弧形切口排开，从耳后绕到头顶。
10月2日，还在病床上的马赫查尔与印度总理莫迪通了10分钟电话。他告诉莫迪，那一刻自己是在为生命而战；他飞了17年，当机长11年，”闭着眼也知道飞机里正在发生什么”。在过道上，他想着儿子和女儿。他后来回忆称：”我放弃了吗？没有。我可以百分之百地告诉你，我没有放弃。但我当时确定自己能活下来吗？不能。”
10月18日，马赫查尔表示，希望尽快复飞，”等不及要穿上制服回去工作”。迪拜航空表示，公司对机长、当班飞行员和机组”无比骄傲”，感谢公众、媒体以及事发当天帮助机组的乘客，同时表示正全面配合有关当局的调查。
